آدرس ایمیل خود را وارد نمایید
ثبت
پیام خود را بنویسید
جلد 12، شماره 1 - ( فصلنامه علمی - پژوهشی بيماري‌هاي پستان ايران 1398 )
جلد 12 شماره 1 صفحات 47-39 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Tabatabaei A, Derhami V, Sheikhpour R, Pajoohan M R. Diagnosis of Breast Cancer Subtypes using the Selection of Effective Genes from Microarray Data. ijbd 2019; 12 (1) :39-47
URL: http://ijbd.ir/article-1-722-fa.html
URL: http://ijbd.ir/article-1-722-fa.html
طباطبایی ابوالفضل، درهمی ولی، شیخ پور راضیه، پژوهان محمدرضا. تشخیص نوع سرطان پستان با استفاده از انتخاب ژن‌های موثر از داده‌های ریزآرایه. بیماری‌های پستان ایران. 1398; 12 (1) :39-47
1- گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران
2- گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران ، vderhami@yazd.ac.ir
3- گروه مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران
2- گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران ، vderhami@yazd.ac.ir
3- گروه مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران
چکیده: (4263 مشاهده)
مقدمه: تشخیص زودهنگام سرطان پستان و ژن‌های موثر در آن نقش بسیار کلیدی در درمان و حیات بیمار ایفا می‌کند. با استفاده ازداده‌های بیان ژن استخراج شده از فناوری ریزآرایه و الگوریتم‌های یادگیری ماشین می‌توان روش‌های نوین و هوشمندی درنظام سلامت و درمان ارایه داد که با دقت بالایی قادر به تشخیص سرطان پستان باشند.
روش بررسی: داده‌های استفاده شده در این پژوهش، شامل داده‌های بیان9216 ژن مربوط به 84 بیمار در 5 نوع مختلف سرطان است که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است. در این مطالعه برای افزایش کارایی سیستم‌های تشخیص سرطان پستان، روش انتخاب ویژگی مبتنی بر ارتباط بین بیان غیرنرمال ژن و سرطان ارایه شده است. سپس از سه دسته‌بند پرکاربرد و رایج K- نزدیک‌ترین همسایه (KNN)، ماشین بردار پشتیبان (SVM) و بیزی ساده (NB) برای سنجش کارایی ژن‌های انتخاب شده استفاده شد.
یافته‌ها: بررسی‌های انجام شده نشان دادند که با روش انتخاب ویژگی پیشنهادی و با استفاده از دسته‌بند KNN می‌توان فقط با انتخاب 38 ژن از میان 9216 ژن مربوط به داده‌های بیماران سرطانی که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است، انواع سرطان پستان بیماران در داده‌های آزمایش را با دقت 100% تشخیص داد و ژن‌های مرتبط با هر کلاس را نیز تفکیک کرد. همچنین با استفاده از دسته‌بند NB، دقت 90% با 17 ژن و با دسته‌بند SVM، دقت 67/96% با 22 ژن انتخابی به‌دست آمد.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان دادند که روش انتخاب ویژگی پیشنهادی، با در نظر گرفتن همزمان دو معیار دقت و تعداد ژن انتخابی، عملکرد مناسبی نسبت به سایر روش‌ها دارد. توانایی تفکیک ژن‌های موثر در هر کلاس سرطان، به‌علاوه تشخیص بیان بیشتر از حد یا کمتر از حد ژن‌های انتخابی، از خصوصیات ویژه روش پیشنهادی است که می‌تواند مورد استفاده متخصصین و پژوهشگران حوزه درمان و مراقبت قرار گیرد.
روش بررسی: داده‌های استفاده شده در این پژوهش، شامل داده‌های بیان9216 ژن مربوط به 84 بیمار در 5 نوع مختلف سرطان است که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است. در این مطالعه برای افزایش کارایی سیستم‌های تشخیص سرطان پستان، روش انتخاب ویژگی مبتنی بر ارتباط بین بیان غیرنرمال ژن و سرطان ارایه شده است. سپس از سه دسته‌بند پرکاربرد و رایج K- نزدیک‌ترین همسایه (KNN)، ماشین بردار پشتیبان (SVM) و بیزی ساده (NB) برای سنجش کارایی ژن‌های انتخاب شده استفاده شد.
یافته‌ها: بررسی‌های انجام شده نشان دادند که با روش انتخاب ویژگی پیشنهادی و با استفاده از دسته‌بند KNN می‌توان فقط با انتخاب 38 ژن از میان 9216 ژن مربوط به داده‌های بیماران سرطانی که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است، انواع سرطان پستان بیماران در داده‌های آزمایش را با دقت 100% تشخیص داد و ژن‌های مرتبط با هر کلاس را نیز تفکیک کرد. همچنین با استفاده از دسته‌بند NB، دقت 90% با 17 ژن و با دسته‌بند SVM، دقت 67/96% با 22 ژن انتخابی به‌دست آمد.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان دادند که روش انتخاب ویژگی پیشنهادی، با در نظر گرفتن همزمان دو معیار دقت و تعداد ژن انتخابی، عملکرد مناسبی نسبت به سایر روش‌ها دارد. توانایی تفکیک ژن‌های موثر در هر کلاس سرطان، به‌علاوه تشخیص بیان بیشتر از حد یا کمتر از حد ژن‌های انتخابی، از خصوصیات ویژه روش پیشنهادی است که می‌تواند مورد استفاده متخصصین و پژوهشگران حوزه درمان و مراقبت قرار گیرد.
متن کامل [PDF 671 kb]
(2346 دریافت)
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان دادند که روش انتخاب ویژگی پیشنهادی، با در نظر گرفتن همزمان دو معیار دقت و تعداد ژن انتخابی، عملکرد مناسبی نسبت به سایر روش‌ها دارد. توانایی تفکیک ژن‌های موثر در هر کلاس سرطان، به‌علاوه تشخیص بیان بیشتر از حد یا کمتر از حد ژن‌های انتخابی، از خصوصیات ویژه روش پیشنهادی است که می‌تواند مورد استفاده متخصصین و پژوهشگران حوزه درمان و مراقبت قرار گیرد.
نوع مطالعه: پژوهشي |
دریافت: 1397/11/24 | پذیرش: 1398/1/25 | انتشار: 1398/3/1
دریافت: 1397/11/24 | پذیرش: 1398/1/25 | انتشار: 1398/3/1
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
