جلد 14، شماره 1 - ( فصلنامه بيماري‌هاي پستان ايران 1400 )                   جلد 14 شماره 1 صفحات 63-49 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Darzi M, Gorgin S, Majidzadeh-A K, Esmaeili R. Identification of Prognostic Genes in Her2-enriched Breast Cancer by Gene Co-Expression Net-work Analysis. ijbd. 2021; 14 (1) :49-63
URL: http://ijbd.ir/article-1-880-fa.html
درزی محمد، گرگین سعید، مجیدزاده کیوان، اسمعیلی رضوان. شناسایی ژن های مرتبط با پیش‌ آگهی در سرطان پستان Her2-enriched با استفاده از تجزیه و تحلیل شبکه هم‌ بیانی ژنی. فصلنامه بیماری های پستان ایران. 1400; 14 (1) :63-49

URL: http://ijbd.ir/article-1-880-fa.html


دپارتمان ژنتیک، مرکز تحقیقات سرطان پستان، پژوهشکده سرطان معتمد، جهاد دانشگاهی، تهران، ایران ، esmaeili.rezvan@gmail.com
چکیده:   (680 مشاهده)
مقدمه: زیرگروه Her2-enriched در سرطان پستان پیش ­آگهی بدتری نسبت به زیرگروه ­های لومینال دارد. و اخیرا کشف درمان‏ های هدفمند در سایر گروه­ های سرطان پستان منجر به افزایش بقاء بیماران شده است. هدف این مطالعه شناخت ژن­ های موثر در بقای کلی این دسته از بیماران مبتنی بر زیست­ شناسی سامان‏ه ای است.
روش بررسی: مجموعه­­­ داده­­­ های بیان ژن و اطلاعات بالینی 58 بیمار مبتلا به زیرگروه Her2-enriched از اطلس ژنوم سرطان دانلود شد. با استفاده از شبکه هم­بیان ژنی وزن­دار، ماژول­ های هم­ بیان شناسایی شدند. به‏ منظور شناسایی ماژول­ های موثر بر بقای کلی، از رگرسیون کاکس استفاده شد. آنالیز بقاء تک­ژنی در درون ماژول منتخب انجام و در پایان ژن­ های معنی­ دار با استفاده از ابزار DAVID مورد تفسیر عملکردی قرار گرفتند.
یافته ­ها: از میان شش ماژول هم­ بیان شناسایی­ شده، دو ماژول به طور معنی ­دار با پیش ‏آگهی بدتر در بیماران مرتبط بودند. بر مبنای آنالیز بقای تک­ژنی، 39% از ژن­ های ماژول­ منتخب، معنادار شناخته شد که رابطه­ معناداری با مسیرهای زیستی "Ubiquitin mediated proteolysis" و "RNA degradation" داشتند. ژن های CHAMP1، PPP1R26، PRRC2B، KANSL3 و ANAPC2 به‏ ترتیب به عنوان 5 ژن مهم در کاهش بقای کلی شناسایی شدند. همچنین این ژن­ ها در مسیرهای مرتبط با  تقسیم سلولی نقش دارند که تاییدکننده نقش آن‏ها در سرطان است.
نتیجه­ گیری: رویکرد زیست­ شناسی سامان‏ه ای می­ تواند نتایج مناسبی در تحلیل بقاء بیماران داشته باشد. در این مطالعه ژن‏ هایی شناسایی شدند که می­ توانند در مطالعات آزمایشگاهی به عنوان بیومارکرهای پیش ­آگهی­ دهنده بقای کلی بیماران زیرگروه Her2-enriched و همچنین کاندیداهای بالقوه برای درمان هدفمند این دسته از بیماران مورد استفاده قرار گیرند.
متن کامل [PDF 1829 kb]   (212 دریافت)    
نتیجه­ گیری: رویکرد زیست­ شناسی سامان‏ه ای می­ تواند نتایج مناسبی در تحلیل بقاء بیماران داشته باشد. در این مطالعه ژن‏ هایی شناسایی شدند که می­ توانند در مطالعات آزمایشگاهی به عنوان بیومارکرهای پیش ­آگهی­ دهنده بقای کلی بیماران زیرگروه Her2-enriched و همچنین کاندیداهای بالقوه برای درمان هدفمند این دسته از بیماران مورد استفاده قرار گیرند.

نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بیماریهای پستان
دریافت: 1399/11/11 | پذیرش: 1400/1/17 | انتشار: 1400/3/15

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی- پژوهشی بیماری های پستان ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | Iranian Quarterly Journal of Breast Disease

Designed & Developed by : Yektaweb