[صفحه اصلی ]   [Archive]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: جلد 12، شماره 1 - ( فصلنامه علمی - پژوهشی بيماري‌هاي پستان ايران 1398 ) ::
جلد 12 شماره 1 صفحات 39-47 برگشت به فهرست نسخه ها
تشخیص نوع سرطان پستان با استفاده از انتخاب ژن‌های موثر از داده‌های ریزآرایه
ابوالفضل طباطبایی ، ولی درهمی ، راضیه شیخ پور ، محمدرضا پژوهان
گروه مهندسی کامپیوتر، پردیس فنی و مهندسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران ، vderhami@yazd.ac.ir
چکیده:   (410 مشاهده)
مقدمه: تشخیص زودهنگام سرطان پستان و ژن‌های موثر در آن نقش بسیار کلیدی در درمان و حیات بیمار ایفا می‌کند. با استفاده ازداده‌های بیان ژن استخراج شده از فناوری ریزآرایه و الگوریتم‌های یادگیری ماشین می‌توان روش‌های نوین و هوشمندی درنظام سلامت و درمان ارایه داد که با دقت بالایی قادر به تشخیص سرطان پستان باشند.
روش بررسی: داده‌های استفاده شده در این پژوهش، شامل داده‌های بیان9216 ژن مربوط به 84 بیمار در 5 نوع مختلف سرطان است که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است. در این مطالعه برای افزایش کارایی سیستم‌های تشخیص سرطان پستان، روش انتخاب ویژگی مبتنی بر ارتباط بین بیان غیرنرمال ژن و سرطان ارایه شده است. سپس از سه دسته‌بند پرکاربرد و رایج K- نزدیک‌ترین همسایه (KNN)، ماشین بردار پشتیبان (SVM) و بیزی ساده (NB) برای سنجش کارایی ژن‌های انتخاب شده استفاده شد. 
یافته‌ها: بررسی‌های انجام شده نشان دادند که با روش انتخاب ویژگی پیشنهادی و با استفاده از دسته‌بند KNN می‌توان فقط با انتخاب 38 ژن از میان 9216 ژن مربوط به داده‌های بیماران سرطانی که با استفاده از فناوری ریزآرایه به دست آمده است، انواع سرطان پستان بیماران در داده‌های آزمایش را با دقت 100% تشخیص داد و ژن‌های مرتبط با هر کلاس را نیز تفکیک کرد. همچنین با استفاده از دسته‌بند NB، دقت 90% با 17 ژن و با دسته‌بند SVM، دقت 67/96% با 22 ژن انتخابی به‌دست آمد.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان دادند که روش انتخاب ویژگی پیشنهادی، با در نظر گرفتن همزمان دو معیار دقت و تعداد ژن انتخابی، عملکرد مناسبی نسبت به سایر روش‌ها دارد. توانایی تفکیک ژن‌های موثر در هر کلاس سرطان، به‌علاوه تشخیص بیان بیشتر از حد یا کمتر از حد ژن‌های انتخابی، از خصوصیات ویژه روش پیشنهادی است که می‌تواند مورد استفاده متخصصین و پژوهشگران حوزه درمان و مراقبت قرار گیرد.
واژه‌های کلیدی: سرطان پستان|انتخاب ویژگی|داده‌های ریزآرایه|دسته‌بندی ،
متن کامل [PDF 671 kb]   (110 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بیماریهای پستان
دریافت: ۱۳۹۷/۱۱/۲۴ | پذیرش: ۱۳۹۸/۱/۲۵ | انتشار: ۱۳۹۸/۳/۱
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان دادند که روش انتخاب ویژگی پیشنهادی، با در نظر گرفتن همزمان دو معیار دقت و تعداد ژن انتخابی، عملکرد مناسبی نسبت به سایر روش‌ها دارد. توانایی تفکیک ژن‌های موثر در هر کلاس سرطان، به‌علاوه تشخیص بیان بیشتر از حد یا کمتر از حد ژن‌های انتخابی، از خصوصیات ویژه روش پیشنهادی است که می‌تواند مورد استفاده متخصصین و پژوهشگران حوزه درمان و مراقبت قرار گیرد.

ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tabatabaei A, Derhami V, Sheikhpour R, Pajoohan M R. Diagnosis of Breast Cancer Subtypes using the Selection of Effective Genes from Microarray Data. ijbd. 2019; 12 (1) :39-47
URL: http://ijbd.ir/article-1-722-fa.html

طباطبایی ابوالفضل، درهمی ولی، شیخ پور راضیه، پژوهان محمدرضا. تشخیص نوع سرطان پستان با استفاده از انتخاب ژن‌های موثر از داده‌های ریزآرایه. فصلنامه علمی - پژوهشی بیماری های پستان ایران. 1398; 12 (1) :39-47

URL: http://ijbd.ir/article-1-722-fa.html



جلد 12، شماره 1 - ( فصلنامه علمی - پژوهشی بيماري‌هاي پستان ايران 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
فصلنامه علمی- پژوهشی بیماری های پستان ایران Iranian Quarterly Journal of Breast Disease

Iranian Journal of Breast Diseases Accepted terms and conditions of:

Creative Common Attribution Committee on Publication Ethics: COPE World Association of Medical Editors International Committee of Medical Journal Editors
Persian site map - English site map - Created in 0.08 seconds with 32 queries by YEKTAWEB 3991