مقدمه: زیرگروه Her۲-enriched در سرطان پستان پیش آگهی بدتری نسبت به زیرگروه های لومینال دارد. و اخیرا کشف درمان های هدفمند در سایر گروه های سرطان پستان منجر به افزایش بقاء بیماران شده است. هدف این مطالعه شناخت ژن های موثر در بقای کلی این دسته از بیماران مبتنی بر زیست شناسی سامانه ای است.
روش بررسی: مجموعه داده های بیان ژن و اطلاعات بالینی ۵۸ بیمار مبتلا به زیرگروه Her۲-enriched از اطلس ژنوم سرطان دانلود شد. با استفاده از شبکه همبیان ژنی وزندار، ماژول های هم بیان شناسایی شدند. به منظور شناسایی ماژول های موثر بر بقای کلی، از رگرسیون کاکس استفاده شد. آنالیز بقاء تکژنی در درون ماژول منتخب انجام و در پایان ژن های معنی دار با استفاده از ابزار DAVID مورد تفسیر عملکردی قرار گرفتند.
یافته ها: از میان شش ماژول هم بیان شناسایی شده، دو ماژول به طور معنی دار با پیش آگهی بدتر در بیماران مرتبط بودند. بر مبنای آنالیز بقای تکژنی، ۳۹% از ژن های ماژول منتخب، معنادار شناخته شد که رابطه معناداری با مسیرهای زیستی "Ubiquitin mediated proteolysis" و "RNA degradation" داشتند. ژن های CHAMP۱، PPP۱R۲۶، PRRC۲B، KANSL۳ و ANAPC۲ به ترتیب به عنوان ۵ ژن مهم در کاهش بقای کلی شناسایی شدند. همچنین این ژن ها در مسیرهای مرتبط با تقسیم سلولی نقش دارند که تاییدکننده نقش آنها در سرطان است.
نتیجه گیری: رویکرد زیست شناسی سامانه ای می تواند نتایج مناسبی در تحلیل بقاء بیماران داشته باشد. در این مطالعه ژن هایی شناسایی شدند که می توانند در مطالعات آزمایشگاهی به عنوان بیومارکرهای پیش آگهی دهنده بقای کلی بیماران زیرگروه Her۲-enriched و همچنین کاندیداهای بالقوه برای درمان هدفمند این دسته از بیماران مورد استفاده قرار گیرند.
