مجله علمی

مقدمه: فرآیند مولکولی تومورزایی در سرطان پستان به‌طور کامل شناخته نشده است و شناسایی ژن‌های مربوط به آن، مکانیسم‌های مولکولی اولیه سرطان را روشن می‌سازد. هدف این مطالعه، شناسایی ژن‌هایی با بیان متفاوت دخیل در بیماری‌زایی و پیش‌آگهی سرطان پستان از طریق آنالیز بیوانفورماتیک است.
روش بررسی: مجموعه داده‌های GSE45827، GSE65194، و GSE42568 از قسمت Gene Expression Omnibus در پایگاه داده NCBI جهت شناسایی ژن‌های با بیان متفاوت دانلود و آنالیز شدند. هستی شناسی و مسیر ژنی در KEGG  نیز مورد مطالعه قرار گرفت. سپس برهمکنش پروتئین-پروتئین توسط پایگاه داده STITCH رسم و با استفاده از افزونه MCODE در نرم افزار Cytoscape تحلیل شد. سطح بیان ژن‌های هاب با استفاده از UALCAN و Kaplan-Meier plotter آنالیز و سپس با استفاده از CTD شبکه تعاملی ژن-دارو ایجاد شد.
یافته‌ها: در مجموع 599 ژن‌ها با بیان متفاوت انتخاب و چهار ژن هاب با بیشترین تعامل در شبکه، به کمک پایگاه داده GTEx  شناسایی شدند. نتایج نشان داد که NDE1، RAD21، ZWILCH و ZWINT ممکن است ژن‌های کلیدی در مسیرهای چرخه سلولی، P53، PI3K-Akt و AMPK و پیشرفت سرطان پستان باشند.
نتیجه‌گیری: با توجه به نقش کلیدی چهار ژن هاب در مسیرهای اساسی و شناخته شده سرطان پستان، این ژنها می‌توانند به عنوان نشانگرهای زیستی بالقوه با ارزش پیش آگهی و اهداف درمانی نوین در نظر گرفته شوند. درک بهتر این ژن ها و مسیرها می تواند به جلوگیری از پیشرفت سرطان پستان کمک کند. بنابراین تحقیقات بیشتری در این زمینه مورد نیاز است.